Die MEDIDATA ist die zentrale Daten-Sammelstelle von mehreren Krankenkassen (wie z.B. CSS, Helsana, Visana, Wincare) und der SUVA fürs elektronische Abrechnen. Zweck dieser Datenzentrale ist die Gewährleistung der Vermittlung eines einheitlichen elektronischen Datenformats von den Leistungserbringern zu den Versicherern.
Mit der Schnittstelle im AESKULAP kann die Arztpraxis die Rechnungsdaten via Internet direkt an die MEDIDATA schicken. Von der MEDIDATA werden sie an die entsprechenden Versicherer weitergeleitet. Beim elektronischen Rechnungsversand an die MEDIDATA erfolgt die Bezahlung von den meisten Versicherern direkt an die Ärztinnen und Ärzte. Dies auch in Kantonen, in denen die Rechnungsstellung üblicherweise direkt an den Patienten erfolgt.